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domingo, 17 de noviembre de 2019

PCR en Diabetes Mellitus tipo 2

Tema: Detection of VDR gene ApaI and TaqI polymorphisms in patients with type 2 diabetes mellitus using PCR-RFLP method in a Turkish population

0bjetivo: Study if there was an association of VDR: g.59979GNT or c.1025- 49GNT (ApaIGNT) and g.60058TNC or c.1056TNC (TaqITNC) polymorphisms in the 3′ untranslated region of VDR with T2DM in a Turkish population.

Muestra: Sangre de los pacientes en tubos EDTA-blood 

Tipo: ADN genómico humano

Extracción: Standard salting out procedure


Gen: Gen VDR: Receptor de la vitamina D
         gen. 59979GNT o c.1025-49GNT (ApaIGNT))
         gen. 60058TNC o c.1056TNC (TaqITNC) 

PCR: PCR Multiplex

El programa de PCR touchdown se realizó a 94 ° C durante 3 min (desnaturalización inicial), 11 ciclos con 94 ° C durante 30 s, 72 a 62 ° C durante 30 s (disminuyendo 1 ° C por ciclo) y 72 ° C durante 30 s y 20 ciclos con 94 ° C durante 30 s, 62 ° C durante 30 s, 72 ° C 30 s, y 72 ° C durante 5 min (extensión final).

Visualización: Electroforesis 

Sensibilidad y Especificidad: Se usa para detectar mutaciones en los receptores y genes.

PCR products of Type 2 diabetes mellitus. The product lengths were 215bp for GSTM1, 480bp for GSTT1 and 268bp for beta globin. Lanes (3,5&7) heterozygous for GSTT1 and GSTM1. Lanes (8&9) homozygous deletion for GSTM1. Lanes (1,2&10) absence of PCR product for GSTM1 or GSTT1 in the presence of beta globin band was indicative of a null genotype for GSTM1 or GSTT1. Lane M is φXM.  


Referencias:
Dilmec F, Uzer E, Akkafa F, Kose E, van Kuilenburg ABP. Detection of VDR gene ApaI and TaqI polymorphisms in patients with type 2 diabetes mellitus using PCR-RFLP method in a Turkish population. J Diabetes Complications. mayo de 2010;24(3):186-91. 

disponible en: 

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